第一款深度学习软件被开发为一种多功能工具，可用于跟踪细胞并从蠕动的蠕虫大脑，斑马鱼心脏中的约100个细胞以及3D显微镜视频中的约1,000个癌细胞中提取信号。该方法展示了对各种指标的跟踪功能的重大改进，包括可能的跟踪对象数，健壮性和计算要求。

在现代基础生命科学研究以及药物发现中，随着时间的流逝，使用3D显微镜记录和分析细胞图像已变得极为重要。一旦记录了图像，由于在图像中捕获的活细胞正在运动，因此必须准确地识别不同时间点不同图像中的相同细胞(细胞跟踪)。但是，在3D显微镜视频中自动跟踪许多细胞非常困难。

在名古屋市大学木村实验室，Chentao Wen博士及其同事开发了第一个基于AI的软件，称为3DeeCellTracker，该软件可以在台式PC上运行并自动跟踪3D显微镜视频中的细胞。使用该软件，他们能够测量和分析移动的细线蠕虫的大脑中，幼小的小鱼的自然跳动心脏中约100个细胞的活性，以及在实验室条件下以3D方式培养的约1000个癌细胞的活性。用不同类型的尖端显微镜系统进行记录。

现在，该多功能软件可用于生物学，医学研究和药物开发，以帮助监测细胞活动。

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