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通过绘制其遗传基础图,加利福尼亚大学圣地亚哥分校医学院的研究人员确定了特定细胞类型在1型糖尿病中的预测因果作用,该病影响超过160万人。研究结果发表在2021年5月19日的在线《自然》杂志上。
1型糖尿病是一种复杂的自身免疫性疾病,其特征是胰岛素分泌性胰岛β细胞的损伤和丧失以及随后的高血糖症(高血糖),对身体造成损害,并可能引起其他严重的健康问题,例如心脏病和视力失利。1型糖尿病比2型糖尿病少见,但其患病率正在上升。疾病预防控制中心预测,到2050年,将有500万人患有1型糖尿病。目前,没有治愈方法,只有疾病控制方法。
对1型糖尿病的机制,包括如何引发自身免疫,了解甚少。由于它具有很强的遗传成分,因此近年来进行了许多全基因组关联研究(GWAS),研究人员比较了具有相同疾病或状况的人的整个基因组,以寻找可能与之相关的遗传密码上的差异。该疾病或状况。
在1型糖尿病的情况下,已在基因组的非编码区很大程度上发现了已确定的高风险变异体。在《自然》研究中,资深作者Kyle Gaulton博士,加州大学圣地亚哥分校医学院儿科学系助理教授,及其同事将GWAS数据与外周血和胰腺细胞类型的表观基因组图谱进行了整合。表观映射细节如何以及何时基因在接通和关断单元,从而确定制作到特定细胞功能的重要蛋白质。
具体来说,研究人员进行了迄今为止最大的1型糖尿病GWAS,分析了520,580个基因组样本,以确定69个新的关联信号。然后他们绘制了胰腺和外周血细胞类型中的448,142个顺式调控元件(基因中或附近的非编码DNA序列)。
“通过结合这两种方法,我们能够确定疾病变体的细胞类型特异性功能,并发现胰腺外分泌细胞在1型糖尿病中的预测因果作用,我们能够通过实验进行验证,” Gaulton说。
胰腺外分泌细胞产生分泌到小肠中的酶,这些酶可以帮助消化食物。
医学博士,加州大学圣地亚哥分校医学院儿科和细胞与分子医学系教授,儿科糖尿病研究中心主任迈克·桑德(Maike Sander)医学博士说,这些发现代表了对理解1型糖尿病病因的重大飞跃。。她将这项工作描述为“具有里程碑意义的研究”。
“这意味着外分泌细胞功能障碍可能是疾病的主要诱因。这项研究提供了遗传路线图,从中我们可以确定哪些外分泌基因可能在疾病发病机理中起作用。”
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